Наверное главной причиной атеизма является дискредитация Божеств той или иной религией, при которой её лидеры и приверженцы, с именем своего Бога лгали, отбирали и убивали. Наверное, ведь не всякий после этого готов молиться тому, чей образ запачкан несправедливостью, насилием и кровью.
Две последние причины атеизма - научная точка зрения, а также банальное и, вполне себе, логичное нежелание поклоняться невидимому.