В 18 лет Франческа поступила в военную академию вместо своего болезненного брата под именем Франца Сканагатты.
Закончила академию и была выпущена на действительную службу знаменосцем 6-го пограничного полка австрийской армии.
Принимала участие в боях за Галицию, в обеих Итальянских кампаниях и была тяжело ранена при осаде Генуи.
В 1800г. получила звание лейтенанта.
После разоблачения, Франц 2 назначил ей армейскую пенсию с правом ношения мундира.
В 1804г. вышла замуж и родила четверых детей.