Новая генетика и днк-информатика

 
               
 
 
 Курносов М. Н.
 НОВАЯ ГЕНЕТИКА
 И
 ДНК-ИНФОРМАТИКА
 (ПРОЕКТ НЕОГЕРМЕТИК)
 2013.
 НАУЧНОЕ ИЗДАНИЕ.

                ПРЕДИСЛОВИЕ.
 
 Термин "новая генетика" я применяю для постгеномной эпохи в биологии.  Это
время началось примерно с 2003 года,  когда был опубликован впервые геном
человека. Биология и медицина вступила на новый,более высокий уровень знаний.
Нам  понятно,  что  секвенирование  геномов   проводится  не  только из-за
теоретического интереса.    Все в настоящее время направлено на то,  чтобы
научиться влиять на гены как человека,  так и других организмов.
Новая генетика ставит и новые цели - это изменение самой биологии человека,
а именно влияя на гены сделать человека невосприимчивым к обычным болезням,   
значительно продлить жизнь человека,  сделать его максимально устойчивым к
вредным   факторам среды   (излучениям,  высокой и низкой температуре, 
повышенному или пониженному парциальному давлению кислорода в воздухе, 
измененному давлению), а также сделать человека независимым от обычной пищи, 
устойчивость к химическим мутагенам,  невосприимчивость к микробам и вирусам, 
высокая скорость регенерации повреждений и так далее. Управление генами
человека скоро выйдет на новый уровень,  что изменит всю его жизнь.
После того , как геном был определен в виде нуклеотидной последовательности, 
стало ясно,  что знаем мы о генах очень мало, и сегодня , несмотря на вал
научных работ, я могу утверждать,  что в познании генома и генетике человека
все  еще только начинается и окончательного изучения работы генома можно
ожидать через 20-30 лет.
Геном человека представляет настолько информационно большую величину, которую
сегодня даже трудно представить. Так как дело не только в количестве
нуклеотидов ДНК, а именно в их сочетаниях в каких-то оригинальных участках,
доменах, мотивах, повторах. Это придает геному человека гораздо более
информационную емкость, чем только сама последовательность. Этим сейчас
занимается ДНК-информатика. Расшифровка биологического значения и функций
участков ДНК, моделирование и создание новых информационных участков ДНК и
так далее. Я приведу в этой книге те примеры, которые сам разрабатывал.
В науке сегодня ведуться работы по созданию геномодифицированного человека. В
одних странах это под запретом, но я думаю, что ненадолго. Как только люди
поймут , что опасность, которую предполагали от этого, настолько мала по
сравнению с пользой, которую принесет для человека его геномодификация, то
эти запреты будут сняты. Главное время не упустить. Работы можно начать в
любое время сегодня, были бы средства и желание развивать науку.
У человечества нет другого пути, либо болеть,  рано умирать и быть уязвимым в
окружающей среде, либо изменить человека.
Мой проект я назвал NEOGERMETIC, что означает новый зародыш, росток,стволовая
клетка. Это негосударственный, частный научный проект. Он находится в
постоянной моей разработке. Проект НЕОГЕРМЕТИК включает в себя разработку
способов кодирования текстов в ДНК, внесение этой ДНК  в геном для
длительного хранения. Также рассматриваются вопросы поиска в ДНК человека и
других организмов разумных текстов.
Эта книга в виде отдельных статей описывает разные способы преобразования
генетической информации в другие виды информации. Также поиск в ДНК возможных
участков, несущих информацию, не связанную с работой генов, то есть разумных
текстов, похожих на тексты обычных книг.
В других главах затронуты вопросы старения в связи с митохондрией и
транспозонами. Работы продолжаются несколько лет и возможные открытия еще
впереди. В книге даны разработки пока теоретических подходов, начальная
информация для других ученых, которые будут заниматься тем же, что и я.
Если в геноме какого-то организма будут найдены разумные тексты в виде
послания или просто технологические разумные метки высшей цивилизации,
проводившей генные операции, то это будет означать самое выдающееся открытие
в истории человечества.
Уже сегодня ученые могут ввести в ДНК участки с любыми текстами. Чтобы знать,
что надо искать в геноме, надо научиться вводить тексты в ДНК. Это описывают
несколько глав в этой книге. Итак, представляю Вам мою книгу, и что было
разработано по мере моих сил за последние 8 лет. Материалы могут быть
спорными по некоторым местам, но это и есть наука – от гипотез и черновых
наработок через теорию к практике.
Возле каждой главы стоит дата публикации статьи в интернете на моем сайте
www.neogermetic.narod.ru , поскольку в науке все стремительно меняется.
Частично книга дописывалась в течение 2013 года.
 01 мая 2013 г.

 
                Оглавление.
 
 Предисловие.                3
 Введение в современную ДНК информатику.                4
 10 лет генома человека - все еще только начинается.        6
 Тексты ДНК. Медицина и биология будущего.                8
 Музыка генов человека.                Сообщение 1.        8
 Вопросы по музыке генов.               Сообщение 2.        9
 Музыка генов дрожжей.                Сообщение 3.        10
 Алгоритм музыки генов. Белковые домены. Сообщение 4.       11
 Дополнения по музыке генов.            Сообщение 5.        13
 Музыка генов вируса герпеса типа 2.    Сообщение 6.        14
 Методика создания музыки генов.                15
 Музыка белковых комплексов.            Сообщение 7.        16
 Геном человека и митохондрия. Часть 1.                17
 Геном человека и митохондрия. Часть 2.                18
 Управляемые наномашины - основа терапии будущего.          21
 Гены-гиганты в геноме человека. Сообщение 1.               22
 Гены-гиганты в геноме человека. Сообщение 2.               25
 Гены-гиганты в геноме человека. Интрогены. Сообщение 3.    27
 Гены-гиганты в геноме человека. Транспозоны. Сообщение 4.  27
 Гены-гиганты в геноме человека. Дефрагментация генов -
 природный феномен. Сообщение 5                30
 Дополнение по генам гигантам                31
 Где находится память у человека.                32
 Микоплазма, транспозоны, эволюция и здоровье человека.
 Часть 1.                34
 Микоплазма, транспозоны, эволюция и здоровье человека.
 Часть 2.                37
 Полезные гены животных, растений и микробов -
 в геном человека.                38
 Растения - генные контейнеры и химические лаборатории.     39
 Что же такое - разумное послание в геномах?                40
 Кодоны в ДНК и разумность последовательности.              41
 Генное программирование и ДНК говорит. Ген PUSHKIN.        44
 Стихотворение А. С. Пушкина "Осень" в виде гена.           45
 Функциональные элементы генома и ДНК информатика           50
 Биоинформатика и белки.                52
 ДНК говорит. Способы кодирования. Часть 1.                53
 ДНК говорит. Способы кодирования. Часть 2.                54
 ДНК говорит. Способы кодирования. Часть 3.                54
 ДНК говорит. Способы кодирования. Часть 4.                55
 ДНК говорит. Ввод биологической части словаря.             57
 ДНК говорит. Способы кодирования. Введение графических
 изображений с помощью ДНК.        Часть 5.                58
 ДНК говорит. Способы кодирования. Визуально-особые,
 магические участки генома.        Часть 6.                59
 ДНК говорит. Способы кодирования. Гены-маркеры.            
                Часть 7.                61
 ДНК говорит. Способы кодирования. Структура ДНК -
 возможный маркер посланий.        Часть 8.                62
 ДНК говорит. Способы кодирования. Особенности живой ДНК.
                Часть 9.                64
 ДНК говорит на языке человека.                65
 Пример искаженной информационной последовательности и ее
 коррекция.                70
 Самые большие белки, кодируемые геномом человека.          75
 Теломера хромосомы и теории старения.                77
 Гены поддержки высших психических свойств человека.        83
 Окончание.                87
 Заключение.                88
 Об авторе.                88
 Гены компонентов митохондрий в хромосомах ядра человека.
                Приложение 1.             89
 Гены митохондрии человека.       Приложение 2.            100
 Список генов-гигантов человека, размером более 400 тпн и
 их функция.                Приложение 3.            101
 Гены сплайсинга.                Приложение 4.            111
 Список больших белков человека.  Приложение 5.            116
 Список повторов в изученных интронах генов-гигантов.
                Приложение 6.            123
 Примеры участков, которые сразу бросаются в глаза,
 визуально-особые участки генома. Приложение 7.            131
 Примеры участков генома микоплазмы гениталиум G37,
 подобные повторам и транспозонам
 человека.                Приложение 8.            141
 Примеры сравнения микоплазмы гениталиум с HTRVK и LINE 1
 с помощью программы BLAST.       Приложение 9.            143
 Разбика гена PUSHKIN на отдельные кодоны и количество
 различных кодонов в гене PUSHKIN.Приложение 10.           144
 Пример трансляции гена PUSHKIN.  Приложение 11.           145
 Промилле кодонов для человека. Количество различных
 кодонов в гене PUSHKIN.          Приложение 12.           147
 Литература                148
 Оглавление.                150